Para todos ellos se ha diseñado el sistema de gestión, integrando en muchos casos la utilización aguas ácidas almacenadas en antiguas balsas de lodos o cortas mineras abandonadas y utilizándolas como fuente principal de abastecimiento de la planta de tratamiento de mineral.
Como parte del sistema de gestión de aguas, y para alguno de los proyectos ya mencionados, se han diseñado sistemas de tratamiento de efluentes, bien para descarga al medio natural, reutilización como agua de proceso, o aprovechamiento de metales disueltos, mediante: